Attività di Laboratorio: Il Laboratorio di Modellistica Molecolare (LMM) del Dipartimento di Farmacia rappresenta un punto di riferimento per coloro che intendono approcciarsi al mondo del Drug Discovery e della Computational Biology, essendo stato uno dei primi laboratori in Italia ad occuparsi di chimica computazionale. Il LMM è inoltre sede di continui scambi di conoscenze ed esperienze con rinomati laboratori internazionali. L'attività scientifica del LMM verte principalmente sullo sviluppo ed applicazione di metodologie avanzate di bio e chemo-informatica in ambito biofarmaceutico. Le tecniche utilizzate comprendono metodi quantomeccanici, homology modelling, docking molecolare, virtual screening, de novo small molecules design, predizione delle proprietà ADMET, dinamica molecolare e metodi di free energy come la metadinamica. Tali metodologie hanno lo scopo principale di supportare il processo di Drug Discovery, consentendo di individuare nuovi composti come potenziali lead e di caratterizzarne a livello molecolare il meccanismo d'azione e le modalità di interazione con un determinato bersaglio molecolare di interesse terapeutico. Inoltre, esse consentono di studiare processi di folding/unfolding di biosistemi quali peptidi, proteine e DNA, e di investigare i cambi conformazionali di recettori, sia di membrana che citosolici, in assenza e in presenza di ligandi endogeni o di composti farmacologicamente attivi. L'attività del LMM beneficia, inoltre, di dati ottenuti mediante tecniche sperimentali (ad esempio NMR, MS e ITC), frequentemente integrati nel corso delle elaborazioni computazionali. 

Elenco delle attrezzature

Il Laboratorio di Modellistica Molecolare è equipaggiato con 20 workstation professionali di ultima generazione per analisi e grafica molecolare nonché con un cluster HPC ibrido CPU/GPU ad alta prestazione dotato di 560 processori Intel® Xeon® Gold e 64 processori AMD® EPYC® per un totale di 624 cores di calcolo, e 2 GPU NVIDIA® Tesla® V100, integrato con un ampio sistema di storage per l'archiviazione dei dati.

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  • Telefono: 081 678 613, e-mail: antonio.lavecchia@unina.it